Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP18Q9UMW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP18Q9UMW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP18Q9UMW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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