Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN16Q9UKR8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN16Q9UKR8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms