Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCTPQ9UKL6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCTPQ9UKL6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms