Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FBXL4Q9UKA2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FBXL4Q9UKA2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FBXL4Q9UKA2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms