Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC5Q9UII4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HERC5Q9UII4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms