Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GPN3Q9UHW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms