Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OPN4Q9UHM6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms