Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRDQ9UH36 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRDQ9UH36 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRDQ9UH36 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms