Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5BQ9UGL1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
KDM5BQ9UGL1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms