Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP4Q9UGJ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBGCP4Q9UGJ1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms