Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC6Q9UBN7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC6Q9UBN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC6Q9UBN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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