Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPARGC1AQ9UBK2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms