Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN10Q9UBB4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms