Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUCLA2Q9P2R7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUCLA2Q9P2R7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms