Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HCN3Q9P1Z3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms