Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HMG20BQ9P0W2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HMG20BQ9P0W2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HMG20BQ9P0W2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms