Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AIPL1Q9NZN9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AIPL1Q9NZN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms