Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKIRAS1Q9NYS0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms