Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MIS18AQ9NYP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MIS18AQ9NYP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MIS18AQ9NYP9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms