Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSD3Q9NYI0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSD3Q9NYI0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSD3Q9NYI0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms