Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK1Q9NYA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK1Q9NYA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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