Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX43Q9NXZ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX43Q9NXZ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX43Q9NXZ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms