Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALKBH4Q9NXW9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALKBH4Q9NXW9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms