Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDL2Q9NX52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDL2Q9NX52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms