Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCLQ9NW38 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms