Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARVAQ9NVD7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARVAQ9NVD7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms