Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUT2

ABCB8, ATP-binding cassette sub-family B member 8, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB8Q9NUT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB8Q9NUT2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB8Q9NUT2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms