Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms