Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC18Q9NUE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC18Q9NUE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC18Q9NUE0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC18Q9NUE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC18Q9NUE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms