Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPMQ9NSP4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPMQ9NSP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPMQ9NSP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms