Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT82Q9NSB4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms