Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCND1Q9NSA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCND1Q9NSA2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCND1Q9NSA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms