Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPORSQ9NS56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPORSQ9NS56 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms