Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA4L2Q9NRX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms