Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB6BQ9NRW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB6BQ9NRW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms