Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GLB2Q9NR46 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3GLB2Q9NR46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3GLB2Q9NR46 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms