Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C8orf4Q9NR00 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C8orf4Q9NR00 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms