Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-219ENST00000552657 553 ntTSL 25.54□□□□□ -1.526e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.536e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-210ENST00000548950 663 ntTSL 55.45□□□□□ -1.546e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-214ENST00000551121 612 ntTSL 55□□□□□ -1.616e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-218ENST00000552463 778 ntTSL 54.95□□□□□ -1.626e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-211ENST00000549726 1004 ntTSL 24.87□□□□□ -1.636e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TRDMT1-202ENST00000354631 8230 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.665e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ASPH-216ENST00000519678 536 ntTSL 34.64□□□□□ -1.675e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TRDMT1-205ENST00000436968 257 ntTSL 1 (best)4.52□□□□□ -1.695e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-203ENST00000547082 604 ntTSL 44.36□□□□□ -1.716e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 PRKAG1-215ENST00000551696 688 ntTSL 54.36□□□□□ -1.716e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.766e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.766e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-210ENST00000471833 553 ntTSL 33.73□□□□□ -1.815e-18■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.826e-14■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.566e-27■■■■■ 335.4
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-217ENST00000591358 3743 nt14.25□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 335.1
UTP3Q9NQZ2 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 414.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 334.7
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP2-203ENST00000559195 572 ntTSL 519.89■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 334.5
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-210ENST00000555474 1102 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-205ENST00000554087 1750 ntTSL 511.82□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1D-213ENST00000556058 551 ntTSL 36.58□□□□□ -1.367e-8■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 410.31□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-212ENST00000559937 579 ntTSL 48.61□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 334.2
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-207ENST00000564965 578 ntTSL 416.28■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 333.1
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-8■■■■■ 332.9
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 332.9
UTP3Q9NQZ2 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.72□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 332.9
UTP3Q9NQZ2 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 332
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-11■■■■■ 331.2
UTP3Q9NQZ2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.275e-13■■■■■ 330.7
UTP3Q9NQZ2 MNT-202ENST00000571232 508 ntTSL 420.66■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 330.6
UTP3Q9NQZ2 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 330.6
UTP3Q9NQZ2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 330.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM50A-206ENST00000498135 776 ntTSL 320.69■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 330.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM50A-203ENST00000480937 1102 ntTSL 220.03■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 330.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM50A-202ENST00000468704 799 ntTSL 318.26■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 330.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 330.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM50A-205ENST00000491936 965 ntTSL 1 (best)16.13■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 330.2
UTP3Q9NQZ2 PRMT7-223ENST00000567542 3542 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 329.9
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.919e-7■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.679e-7■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.335e-9■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.219e-7■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-9■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.735e-9■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.675e-9■■■■■ 328.9
UTP3Q9NQZ2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 328.6
UTP3Q9NQZ2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.016e-11■■■■■ 328.3
UTP3Q9NQZ2 GALK2-211ENST00000559423 895 ntTSL 510.33□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 327.8
UTP3Q9NQZ2 GALK2-218ENST00000560138 722 ntTSL 59.9□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 327.8
UTP3Q9NQZ2 GALK2-214ENST00000559883 991 ntTSL 49.73□□□□□ -0.851e-10■■■■■ 327.8
UTP3Q9NQZ2 GALK2-210ENST00000559208 861 ntTSL 57.94□□□□□ -1.141e-10■■■■■ 327.8
UTP3Q9NQZ2 TPM4-207ENST00000588032 712 ntTSL 310.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 FUNDC2-205ENST00000484175 666 ntTSL 324.43■■□□□ 1.52e-18■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-18■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 FUNDC2-206ENST00000485289 726 ntTSL 59.83□□□□□ -0.842e-18■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 FUNDC2-202ENST00000456179 871 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-18■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.28e-7■■■■■ 327.6
UTP3Q9NQZ2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.43e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.383e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.323e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.953e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.193e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 03e-10■■■■■ 327.1
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-203ENST00000494993 1220 ntTSL 223.31■■□□□ 1.321e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.11e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-206ENST00000561036 457 ntTSL 318.39■□□□□ 0.531e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 HDDC3-204ENST00000559834 1076 ntTSL 29.71□□□□□ -0.861e-56■■■■■ 327
UTP3Q9NQZ2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.6■□□□□ 0.731e-20■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 MLLT1-202ENST00000585588 637 ntTSL 317.5■□□□□ 0.391e-21■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 KIF13B-202ENST00000522355 2630 ntTSL 214.54□□□□□ -0.081e-20■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-207ENST00000587145 577 ntTSL 412.21□□□□□ -0.451e-21■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-212ENST00000590457 552 ntTSL 312.21□□□□□ -0.451e-21■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 KIF13B-201ENST00000521515 2765 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.641e-20■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 KIF13B-205ENST00000523968 1750 ntTSL 59.28□□□□□ -0.921e-20■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.031e-21■■■■■ 326.9
UTP3Q9NQZ2 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.71■■□□□ 1.391e-9■■■■■ 326.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 420.81■□□□□ 0.928e-44■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.446e-31■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 414.86□□□□□ -0.038e-44■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 THOC5-210ENST00000443089 786 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-25■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 ADD3-212ENST00000486014 317 ntTSL 37.58□□□□□ -1.26e-38■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 ADD3-216ENST00000488837 590 ntTSL 35.06□□□□□ -1.66e-38■■■■■ 326.1
UTP3Q9NQZ2 PIGG-215ENST00000508562 570 ntTSL 413.72□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 325.6
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■■ 325.6
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