Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNGB3Q9NQW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNGB3Q9NQW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB3Q9NQW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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