Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED4Q9NPJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED4Q9NPJ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms