Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREM1Q9NP99 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms