Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUFT1Q9NNX1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms