Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMURF1Q9HCE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMURF1Q9HCE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms