Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP29Q9HBJ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP29Q9HBJ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms