Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDFQ9HBH1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDFQ9HBH1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms