Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC28A3Q9HAS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC28A3Q9HAS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms