Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NHEJ1Q9H9Q4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms