Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C10orf88Q9H8K7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms