Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSS3Q9H6R3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS3Q9H6R3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSS3Q9H6R3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms