Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XKR8Q9H6D3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XKR8Q9H6D3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XKR8Q9H6D3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms